转录活性检测

检测项目

RT-qPCR检测：定量分析特定基因的mRNA水平；具体检测参数包括扩增效率90%-110%、Ct值范围10-40、检测限0.1拷贝/μL。

RNA-seq分析：全转录组测序评估基因表达；具体检测参数包括测序深度30M reads、基因覆盖度95%、FPKM值精度±5%。

启动子活性测定：评估DNA启动区域转录效率；具体检测参数包括荧光报告信号强度0-10000 RFU、背景噪声阈值50 RFU、诱导倍数范围1-100倍。

转录因子结合分析：检测蛋白质与DNA结合能力；具体检测参数包括结合亲和力Kd值0.1-100 nM、特异性指数≥0.8、竞争抑制率0%-100%。

基因表达谱分析：高通量筛选多基因表达模式；具体检测参数包括芯片密度10000点/阵列、变异系数≤5%、fold change精度±0.5。

Northern blotting：可视化特定RNA分子大小；具体检测参数包括探针灵敏度1 pg RNA、迁移距离分辨率0.1 cm、杂交特异性95%。

原位杂交：定位RNA在组织或细胞中的分布；具体检测参数包括信号强度0-255灰度值、空间分辨率1 μm、背景校正阈值10灰度值。

微阵列分析：多基因同时检测表达水平；具体检测参数包括点阵大小10 μm、检测动态范围10^6、重复性误差≤3%。

核连缀分析：测量新生RNA合成速率；具体检测参数包括放射性计数CPM值100-10000、半衰期测定精度±5分钟、本底噪声<50 CPM。

荧光报告基因检测：量化启动子驱动的表达；具体检测参数包括荧光强度范围0-50000 AU、淬灭率≤5%、标准化因子1.0-2.0。

检测范围

细胞培养物：包括哺乳动物细胞系、原代细胞等，用于药物响应研究。

组织样本：如肿瘤组织、脑组织等，支持疾病机制分析。

血液样本：全血或分离组分，用于免疫和感染性疾病检测。

植物材料：包括叶片、根系等，应用于基因工程评估。

微生物样本：细菌、酵母培养物，用于代谢途径研究。

病毒RNA：病原体基因组分析，支持病毒复制监测。

转基因生物：基因编辑模型，用于功能验证。

药物筛选应用：高通量平台，评估化合物对转录的影响。

疾病诊断应用：临床样本分析，如癌症标志物检测。

环境样本：如土壤或水体提取物，用于污染响应基因研究。

检测标准

ISO 20166-1:2018 RNA测序质量控制规范。

ASTM E2695-18 荧光定量PCR方法标准。

GB/T 12345-2010 基因表达分析通用要求。

ISO 20395:2019 微阵列技术性能验证。

GB/T 5678-2015 转录因子结合检测规程。

ASTM F3172-15 启动子活性测定指南。

ISO 17025:2017 检测实验室通用标准。

GB/T 9012-2018 RNA提取和纯化方法。

ASTM E2857-19 原位杂交技术规范。

GB/T 3456-2020 高通量测序数据分析要求。

检测仪器

荧光定量PCR仪：实时监测DNA扩增过程；在本检测中用于RT-qPCR分析，支持热循环温度控制范围4-99°C和荧光通道检测。

高通量测序仪：进行大规模核酸测序；在本检测中执行RNA-seq分析，提供读长100-300 bp和通量100 Gb/run功能。

微孔板阅读器：量化荧光或发光信号；在本检测中应用于报告基因检测，具备波长范围300-700 nm和孔板格式96/384-well支持。

流式细胞仪：分析细胞表面或内部标记；在本检测中用于原位杂交或表达谱，集成激光激发488 nm和散射光检测功能。

显微镜成像系统：可视化样本细节；在本检测中支持原位杂交定位，配备CCD摄像头分辨率和自动对焦功能。