单细胞测序服务检测

检测项目

细胞捕获效率检测：评估微流控或液滴系统中单个细胞的分离成功率。具体检测参数：捕获率百分比、细胞损失率。

文库制备质量检测：验证反转录和扩增步骤的完整性。具体检测参数：片段长度分布、接头连接效率、引物二聚体比例。

测序深度均匀性检测：分析覆盖基因组的均一程度。具体检测参数：平均深度值、覆盖度偏差系数、低覆盖区域占比。

基因表达定量检测：测量转录本丰度。具体检测参数：转录本每百万计数、基因检出率、表达变异系数。

比对率检测：确定读段与参考基因组的匹配程度。具体检测参数：比对成功率百分比、错误比对率、嵌合读段比例。

细胞聚类分辨率检测：评估细胞类型识别的准确性。具体检测参数：聚类稳定性指数、簇内相似度、簇间差异性。

批次效应检测：识别实验批次间的系统性差异。具体检测参数：主成分分析累积方差、批次校正残差。

污染控制检测：监控外来核酸干扰。具体检测参数：异源DNA比例、微生物污染水平、环境污染物阈值。

数据完整性检测：确保原始数据的可靠性。具体检测参数：文件校验和、序列质量分值、缺失值比率。

变异检测灵敏度检测：评估单核苷酸变异的发现能力。具体检测参数：变异检出限、假阳性率、等位基因频率精度。

分子标签效率检测：验证唯一分子标识符的性能。具体检测参数：标签多样性指数、重复标签率、标签饱和度。

细胞周期分析检测：确定细胞周期状态。具体检测参数：期相分布比例、周期基因表达一致性。

检测范围

肿瘤组织样本：实体瘤或血液瘤的单细胞异质性研究。

免疫细胞图谱：免疫细胞亚群分类和功能状态分析。

神经元网络：脑组织或神经细胞的类型鉴定和连接映射。

干细胞分化：多能干细胞向特定谱系分化的轨迹追踪。

胚胎发育模型：早期胚胎细胞命运决定的动态监测。

微生物群落：环境或宿主相关微生物的单细胞基因组解析。

药物响应评估：药物治疗前后细胞表型变化的量化。

器官类器官：体外培养组织的细胞组成和功能验证。

植物细胞研究：作物或模式植物细胞的发育和应激分析。

疾病生物标志物：特定疾病相关细胞群体的标识物筛选。

再生医学应用：组织修复过程中的细胞再生效率评价。

病原体宿主互作：感染模型中宿主-病原体单细胞互作机制。

检测标准

ISO20387:2018生物样本库通用要求。

GB/T35823-2018高通量测序数据格式规范。

ISO/IEC17025检测和校准实验室能力通用要求。

ENISO15189医学实验室质量和能力要求。

GB/T30988-2014核酸测序方法通则。

ISO5725测量方法与结果的准确度确定。

GB/T27407-2010实验室质量控制规范。

ISO21979生物技术核酸序列验证指南。

GB/T34052-2017基因芯片检测技术规范。

ISO20184-1冷冻生物样本处理标准。

检测仪器

微流体细胞分选仪：集成微通道技术的细胞分离设备。在本检测中用于单细胞捕获和封装功能。

高通量测序平台：基于合成测序原理的核酸序列读取装置。在本检测中执行文库测序和原始数据生成功能。

荧光激活细胞分析仪：利用激光散射和荧光标记的细胞表征工具。在本检测中实现细胞活力评估和表型筛选功能。

核酸质量分析仪：通过毛细管电泳检测核酸片段分布的仪器。在本检测中负责文库片段大小分布验证功能。

热循环扩增仪：程序化温度控制下的核酸扩增设备。在本检测中用于cDNA合成和文库预扩增功能。

超低温存储系统：保持-80℃以下温控的生物样本保存装置。在本检测中执行细胞样本长期稳定性保障功能。

生物信息计算服务器：高性能数据处理单元。在本检测中实现测序数据比对、量化和统计分析功能。

显微成像装置：高分辨率光学观察工具。在本检测中辅助细胞形态学检查和定位功能。