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单细胞测序与高通量测序检测

单细胞测序与高通量测序检测

本文介绍单细胞测序与高通量测序的核心检测项目、适用材料范围、国际国家标准及关键检测仪器。重点涵盖基因组变异、转录组表达等检测参数,应用于肿瘤研究、发育生物学等领域。.

检测项目

单细胞RNA测序:检测细胞转录组表达谱参数包括基因表达量、差异表达基因识别。

单细胞DNA测序:分析基因组变异参数包括单核苷酸多态性、拷贝数变异识别。

染色质可及性分析:评估基因组开放区域参数包括ATAC-seq峰值密度、核小体定位。

细胞表面蛋白表达检测:量化蛋白质水平参数包括抗体标记计数、表面受体丰度。

代谢组学分析:测定细胞代谢产物参数包括代谢物浓度、质谱信号强度。

免疫组库测序:识别免疫多样性参数包括T细胞受体序列多样性、克隆扩增频率。

表观遗传学分析:检测DNA修饰参数包括甲基化位点覆盖率、组蛋白修饰分布。

微生物群落测序:分析微生物组成参数包括16SrRNA序列丰度、物种多样性指数。

空间转录组学:定位基因表达参数包括空间坐标映射、组织区域特异表达。

细胞周期分析:测定细胞分裂阶段参数包括G1/S/G2/M期标记比例、周期蛋白表达。

细胞凋亡检测:评估程序性死亡参数包括caspase激活信号强度、凋亡基因表达。

外显子组测序:聚焦编码区域参数包括外显子覆盖深度、功能性变异评分。

检测范围

肿瘤生物学研究样本:分析癌症细胞遗传异质性支持疾病分子分型。

神经科学组织样本:研究神经元多样性应用于功能网络解析。

发育生物学胚胎样本:追踪干细胞分化过程用于谱系发育建模。

免疫学细胞样本:识别免疫细胞亚群服务于免疫应答机制研究。

植物科学组织样本:探究植物细胞类型应用于作物改良策略。

微生物学群落样本:解析微生物结构服务于环境生态监测。

再生医学干细胞样本:评估治疗疗效用于细胞疗法开发。

药物筛选培养细胞:测试化合物效应应用于新药毒性评估。

环境生物学样本:监测污染响应用于生物修复技术优化。

临床诊断病理样本:辅助疾病诊断支持个性化治疗方案制定。

农业生物技术样本:改进抗性性状用于作物遗传育种。

兽医科学动物样本:研究动物疾病机制应用于野生动物保护。

检测标准

ISO20387:2018生物样本库要求确保样本质量控制一致性。

ISO27001:2013信息安全管理规范数据处理完整性。

GB/T37864-2019生物样本保存标准规定存储条件参数。

GB/T35428-2017高通量测序数据格式统一序列报告。

ASTME1578-18细胞培养标准指导无菌操作流程。

ENISO17025检测实验室能力保障结果可信度。

GB/T34982-2017单细胞测序技术规范设定操作参数。

ISO15189:2012医学实验室质量确保诊断准确性。

ISO1853:2018粉末材料导电性测试参考序列制备。

GB/T1410-2006体积电阻测试应用于电信号分析。

检测仪器

高通量测序平台:进行大规模并行测序功能包括DNA序列读取深度控制。

单细胞分离系统:分离单个细胞功能包括微流体捕获效率优化。

显微镜成像装置:可视化细胞形态功能包括荧光标记定量分析。

数据存储服务器:处理大容量数据功能包括序列比对算法支持。

核酸扩增仪器:执行PCR反应功能包括定量扩增曲线监测。

流式细胞分析仪:分类细胞亚群功能包括表面标记荧光检测。

质谱分析设备:测定代谢产物功能包括离子信号分辨率校准。