染色体高通量测序分析检测

检测项目

全基因组测序(WGS)：覆盖30X深度，检测范围≥99%基因组区域，单碱基准确率Q30≥85%

外显子组测序(WES)：目标区域覆盖度≥95%，平均测序深度100X，插入片段大小150-300bp

拷贝数变异(CNV)分析：分辨率达50kb，检测限LOQ为0.1拷贝数差异，杂合性缺失检出率≥98%

结构变异(SV)检测：包括缺失/重复/倒位/易位，检测精度±5bp，支持＞50bp变异识别

单核苷酸变异(SNV)：灵敏度99.5%，特异性≥99.9%，最低等位基因频率MAF检测阈值为5%

线粒体基因组测序：平均深度5000X，异质性检出限1%，全环覆盖度100%

端粒长度分析：分辨率±50bp，检测范围2-20kb，CV值≤5%

表观遗传分析：涵盖甲基化位点检测，覆盖≥85%CpG岛，单碱基分辨率

嵌合体检测：组织嵌合灵敏度5%，生殖腺嵌合检测限1%

动态突变分析：三核苷酸重复序列精度±1重复单元，检测范围CAG重复10-200次

融合基因检测：断裂点定位精度±5bp，支持未知伴侣基因发现

检测范围

产前诊断样本：羊水细胞、绒毛膜穿刺物，需≥10ng DNA浓度

肿瘤组织标本：FFPE切片厚度＞5μm，肿瘤纯度≥20%

血液系统疾病样本：全血EDTA抗凝，体积≥2ml

遗传病研究材料：家系成员外周血淋巴细胞，采集后72小时内处理

干细胞研究样本：iPSC克隆群体，传代次数≤15

法医生物学检材：毛发毛囊、口腔拭子，DNA完整度DIN值≥7

微生物宏基因组样本：环境拭子、肠道内容物，16S/ITS测序深度50000reads

古DNA研究材料：骨骼化石粉末，处理于古DNA专用洁净室

模式生物基因组：小鼠/斑马鱼/果蝇胚胎组织，需≥50mg起始量

植物育种材料：种子胚乳、叶片组织，多糖多酚含量OD260/280=1.8-2.0

病原体检测样本：病毒载量≥1000copies/ml血浆

检测标准

ISO/IEC 17025:2017 检测实验室能力通用要求

ISO 20395:2018 分子体外诊断检测要求

CLSI MM19-A2 二代测序验证指南

GB/T 30988-2014 高通量基因测序技术规程

GB/T 37872-2019 肿瘤个体化用药基因检测标准

ACMG SF v3.3 临床变异解读指南

CAP NGS验证指南2018版

EN ISO 15189:2022 医学实验室质量体系

GB/T 34796-2017 核酸浓度测定方法

ISO 18385:2016 法医DNA检测防污染标准

检测仪器

Illumina NovaSeq 6000：双流动槽运行模式，单次运行输出6Tb数据，支持PE150测序

Oxford Nanopore PromethION：纳米孔实时测序仪，读长＞100kb，直接RNA检测功能

Agilent 4200 TapeStation：核酸完整性检测，DIN值测定范围1-10，样本通量96个/批次

Qubit 4.0 Fluorometer：高灵敏度核酸定量，检测范围0.05-100ng/μl，CV值＜5%

Covaris M220超声破碎仪：DNA片段化控制精度±15bp，处理时间5分钟/样本

Thermo Fisher KingFisher Flex：自动化核酸纯化系统，磁珠法提取效率≥90%

Bio-Rad CFX96 qPCR：文库定量检测，动态范围10⁷，定量精度±0.5Ct

PacBio Sequel II：长读长测序平台，CCS模式准确率≥99.9%，HiFi读长15kb

10x Genomics Chromium X：单细胞测序系统，支持百万级细胞分选，细胞捕获率≥65%