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基因芯片检测

基因芯片检测

基因芯片检测基于核酸杂交原理,通过高密度探针阵列实现高通量生物信息分析。核心检测环节包括芯片制备质控、杂交反应优化、信号采集精度及数据分析验证,涵盖基因组学、转录组学等多维度生物标志物筛查。需严格遵循生物芯片技术规范及数据分析标准。.

检测项目

探针点制密度检测:单位面积探针数量≥10000点/cm²,CV值≤5%

杂交效率验证:目标序列捕获率≥95%,非特异性结合率≤3%

信号灵敏度检测:最低检出限0.1fmol/μL,信噪比≥30:1

重复性测试:同批次芯片点间变异系数≤8%

背景噪声控制:裸片基底荧光强度≤200RFU

动态范围测定:线性响应范围10³-10⁷拷贝数

交叉反应验证:同源序列干扰率≤5%

热稳定性测试:42℃杂交条件下信号衰减≤15%/h

荧光标记效率:Cy3/Cy5标记率≥98%

数据一致性分析:批间相关系数R²≥0.97

探针退火温度:Tm值偏差±1.5℃

样本兼容性:适用于FFPE/全血/细胞裂解液等样本类型

检测范围

临床诊断芯片:肿瘤驱动基因突变检测(如EGFR/ALK/BRCA)

药物基因组学芯片:CYP450代谢酶多态性分析

病原微生物检测:呼吸道病原体23联检芯片

遗传病筛查芯片:染色体微阵列分析(CMA)

转基因作物检测:35S启动子/NOS终止子等元件筛查

环境微生物监测:水体/土壤微生物群落芯片

食品安全检测:食源性致病菌多重鉴定芯片

法医DNA分型:STR/SNP复合检测系统

药物研发芯片:药物靶点表达谱分析

动植物育种芯片:分子标记辅助选择(MAS)芯片

免疫芯片:自身抗体谱筛查

甲基化检测:CpG岛甲基化水平分析芯片

检测标准

ISO 20387:2018 生物样本库通用要求

GB/T 30988-2014 生物芯片基本术语

ISO/IEC 17025:2017 检测实验室能力通用要求

YY/T 1261-2015 体外诊断用DNA微阵列芯片

GB/T 27924-2011 基因芯片数据格式标准

MIAME标准(微阵列实验最小信息标准)

CLSI MM12-A 微阵列诊断设备验证指南

GB/T 30989-2014 生物芯片点样仪性能检测

ISO 13485:2016 医疗器械质量管理体系

FDA Guidance for Industry: Bioanalytical Method Validation

检测仪器

晶点微阵列点样仪:压电喷墨式点样,最小点径50μm,定位精度±5μm

共聚焦激光扫描仪:双通道同步扫描,分辨率2.5μm,动态范围10⁴

全自动杂交工作站:温控精度±0.2℃,可编程振荡频率5-100rpm

微阵列荧光分析仪:配备488nm/635nm激光源,光子计数检测模式

生物芯片清洗离心机:8芯片并行处理,径向加速度≤500×g

芯片数据采集系统:支持TIFF/JPEG2000格式输出,16位色深

温控杂交箱:温度范围30-65℃,均一性±0.5℃

芯片干燥存储系统:氮气保护环境,湿度≤10%RH

微阵列点阵分析软件:具备网格定位/背景扣除/归一化算法

芯片质检显微镜:自动对焦系统,100倍油镜观察缺陷