亚硫酸氢盐修饰测序分析

检测项目

基因组DNA提取与质量评估：从各类生物样本中分离出高质量的基因组DNA，确保其完整性和纯度满足后续亚硫酸氢盐处理的要求。

亚硫酸氢盐转化处理：利用亚硫酸氢盐试剂对DNA样本进行化学处理，使未甲基化的胞嘧啶脱氨基转变为尿嘧啶。

转化效率计算：通过分析已知非甲基化序列的转化情况，评估整个亚硫酸氢盐处理过程的效率，确保数据可靠性。

PCR引物设计与扩增：针对目标区域设计特异性引物，并对转化后的DNA进行PCR扩增，以富集待测序的片段。

文库构建与质检：将PCR产物制备成适用于高通量测序平台的文库，并对文库的浓度、片段分布进行严格质量控制。

高通量测序：使用下一代测序技术对构建好的文库进行大规模并行测序，获得海量的原始序列读数。

序列比对与映射：将测序得到的读数与参考基因组进行比对，精确定位每个读数在基因组上的来源位置。

甲基化位点识别与calling：通过生物信息学算法，对比对结果进行分析，识别出每个CpG位点的甲基化状态。

差异甲基化区域分析：比较不同样本或不同处理组之间的甲基化水平，鉴定具有统计学显著性的差异甲基化区域。

数据可视化与报告生成：将复杂的甲基化数据以图表形式呈现，并生成包含关键分析结果的综合性报告。

检测范围

人类外周血白细胞DNA：用于研究年龄、环境暴露、生活方式及多种疾病状态对全基因组甲基化模式的影响。

肿瘤组织FFPE样本：从福尔马林固定石蜡包埋的组织中提取DNA，用于癌症相关异常甲基化生物标志物的探索。

植物叶片基因组DNA:应用于植物表观遗传学研究，探讨环境胁迫、发育阶段以及杂交优势中的DNA甲基化调控机制。

小鼠脑组织基因组DNA:在神经科学领域用于分析学习记忆、神经发育及神经系统疾病模型中的表观遗传变化。

细胞系培养物DNA:适用于药物筛选、基因功能研究以及体外模型中特定基因沉默机制的探讨。