纳米孔测序技术检测

检测项目

测序精度：评估DNA序列读取的准确性。具体检测参数：错误率范围0.1%至5%，插入错误比例小于0.5%，删除错误比例小于0.3%。

通量性能：测量单位时间内测序数据产出量。具体检测参数：通量值100万至1000万读长/小时，数据产出率大于90%。

读长分析：确定单次序列读取长度。具体检测参数：平均读长10kb至100kb，最大读长检测上限200kb。

错误类型分布：分析序列错误的发生模式。具体检测参数：替换错误率0.2%至1%，插入错误率0.1%至0.5%，删除错误率0.1%至0.4%。

碱基识别置信度：评估每个碱基识别的可靠性。具体检测参数：置信分数范围0至100，阈值设定为80以上为高置信。

信号噪声比：测量测序信号质量。具体检测参数：噪声比范围10:1至100:1，信号强度检测下限0.1pA。

孔稳定性测试：评估纳米孔在测序中的耐久性。具体检测参数：孔使用寿命100至1000小时，失效频率小于1次/小时。

样本兼容性：检测对不同样本类型的适应性。具体检测参数：DNA浓度范围0.1ng/μl至100ng/μl，RNA样本兼容性测试误差小于5%。

实时性能评估：测量测序过程的实时性。具体检测参数：延迟时间0.1ms至10ms，实时数据捕获率大于95%。

温度影响分析：评估环境温度对测序的影响。具体检测参数：温度范围20C至40C，性能偏差小于2%。

pH值影响测试：检测溶液pH对测序准确性的影响。具体检测参数：pH范围7.0至8.5，错误率变化小于1%。

数据一致性：评估多次测序结果的重复性。具体检测参数：一致性系数0.95至1.00，变异系数小于5%。

通量稳定性：测量长期测序通量的一致性。具体检测参数：通量波动范围5%，检测周期24小时。

碱基偏倚分析：识别特定碱基的检测偏倚。具体检测参数：AT偏倚率-5%至5%，GC偏倚率-5%至5%。

孔堵塞频率：评估纳米孔堵塞的发生率。具体检测参数：堵塞事件频率0.01至0.1次/小时，恢复时间小于1分钟。

检测范围

人类基因组DNA：全基因组测序应用中的DNA样本检测。

细菌基因组：病原体识别和抗菌研究中的细菌DNA分析。

病毒RNA：病毒基因组测序如呼吸道病毒检测。

植物DNA：农业生物技术中的植物基因组研究。

古DNA样本：考古和古生物学中的降解DNA分析。

宏基因组样本：环境微生物群落测序应用。

cDNA：转录组学研究中的互补DNA测序。

质粒DNA：分子生物学实验中的质粒载体检测。

合成寡核苷酸：合成DNA片段的质量控制。

细胞游离DNA：液体活检应用中的循环DNA分析。

法医DNA样本：犯罪现场DNA的识别和测序。

动物基因组DNA：野生动物保护中的DNA测序。

RNA病毒载体：基因治疗中的病毒载体测序。

环境DNA：水体和土壤样本中的DNA提取物。

临床诊断样本：疾病诊断相关的生物样本检测。

检测标准

ISO/IEC17025:2017测试和校准实验室能力的一般要求。

ISO20395:2019生物技术-DNA测序方法性能评估。

GB/T34891-2017高通量测序技术通用要求。

ASTME3130-17核酸测序数据质量评估标准。

GB/T37871-2019生物样本DNA测序质量控制规范。

ISO10993-18:2020医疗器械生物学评价中的DNA测序方法。

GB/T35538-2017临床诊断用DNA测序技术规范。

ISO15189:2012医学实验室质量和能力要求。

ASTMF3207-17纳米材料在生物检测中的应用标准。

GB/T30998-2014生物技术产品DNA测序方法验证。

检测仪器

纳米孔测序设备：用于实时DNA序列读取的仪器。具体功能：测量离子电流变化以识别碱基序列，参数包括分辨率0.1pA，检测范围1kb至200kb读长。

电信号放大器：放大测序过程中产生的微弱信号。具体功能：增强信号质量以降低噪声，参数包括增益范围10至100倍，带宽1kHz至1MHz。

温度控制系统：维持测序环境的稳定温度。具体功能：确保纳米孔性能一致性，参数包括温度控制精度0.5C，范围15C至50C。

数据采集系统：记录和存储测序数据。具体功能：捕获读长和错误率参数，参数包括采样率1kHz至10kHz，存储容量1TB以上。

样本制备设备：处理生物样本以准备测序。具体功能：纯化和浓缩DNA样本，参数包括浓度检测范围0.01ng/μl至100ng/μl，纯度要求A260/A280比1.8至2.0。

质量控制分析仪：评估样本和数据的质量指标。具体功能：测量错误率和通量参数，参数包括精度误差小于1%，通量检测上限1000万读长/小时。