纳米孔测序表观遗传关联检测

检测项目

DNA甲基化检测：识别CpG岛甲基化模式；检测参数：精度±0.1%，覆盖深度30x。

组蛋白修饰检测：分析组蛋白甲基化和乙酰化；检测参数：分辨率1bp，变异系数5%内。

非编码RNA修饰分析：检测RNA甲基化修饰；检测参数：灵敏度1fg，动态范围0-100%丰度。

染色质可及性测定：评估开放染色质区域；检测参数：区域大小10kb，置信度95%以上。

表观遗传标记关联分析：链接修饰与基因表达；检测参数：关联p值<0.05，相关系数>0.8。

DNA羟甲基化检测：量化5-羟甲基胞嘧啶水平；检测参数：精度±0.05%，检出限0.01%丰度。

RNA甲基化分析：测定m6A修饰分布；检测参数：位点密度0.5-5 sites/kb，误差率<1%.

表观基因组关联研究：识别疾病相关修饰；检测参数：样本量>100，测序深度20x.

修饰位点定位：确定特定碱基修饰位置；检测参数：分辨率单碱基，错误率0.5%.

修饰丰度量化：计算修饰频率；检测参数：量化范围0.1-100%，重复性偏差±2%.

检测范围

癌症组织样本：用于肿瘤表观遗传标志物研究。

神经退行性疾病样本：分析脑组织表观修饰变化。

植物基因组表观遗传研究：检测胁迫响应修饰。

微生物群落表观分析：评估环境微生物修饰多样性。

法医DNA鉴定：识别个体特异性修饰模式。

药物响应表观标志物：量化药物治疗后修饰变化。

胚胎发育表观变化：研究发育阶段修饰动态。

环境暴露表观效应：评估污染物引起的修饰。

传染病病原体修饰：分析病毒或细菌表观特征。

个性化医疗基因表达调控：关联修饰与个体化治疗。

检测标准

ISO 17025：确保测试实验室能力通用要求。

ISO 20395：规范生物样品测序质量控制。

GB/T 37875：规定DNA修饰检测方法指南。

GB/T 34060：覆盖表观遗传数据分析标准。

ASTM E3136：设定测序数据验证协议。

ISO 15189：针对医学实验室检测要求。

GB/T 35548：定义RNA修饰检测流程。

ASTM D7686：标准化样品制备方法。

检测仪器

高通量纳米孔测序仪：基于离子电流变化的单分子测序设备；功能：实时捕捉DNA序列信号，检测修饰引起的电流波动。

电信号放大器：放大纳米孔电流信号的电子装置；功能：增强微弱信号，提高修饰检测灵敏度至纳安级。

DNA修饰特异性酶试剂盒：酶处理样本的试剂系统；功能：酶切区分修饰类型，辅助序列比对。

生物信息学分析软件：计算算法平台；功能：解析测序数据，识别和量化表观遗传特征。

样品制备工作站：自动化DNA提取和纯化设备；功能：确保输入样本纯度，减少背景噪声。

实时数据采集系统：记录和存储电流信号的硬件；功能：连续监测测序过程，支持修饰事件捕获。

校准电流源：提供参考电流的装置；功能：校准纳米孔通道，保证测量精确度。