本检测系统阐述了蛋白质组学样品抑制剂靶向性检测的核心技术体系。本检测围绕检测项目、检测范围、检测方法及检测仪器设备四个维度展开,详细介绍了从样品前处理到数据分析的全流程关键环节,旨在为评估小分子抑制剂、生物制剂等对特定蛋白质靶点的选择性、亲和力及作用机制提供全面的技术参考与方案指导。
核心优势
检测中心实验室配备国内外的前沿分析检测设备,检测报告获得CNAS、CMA双重认证,国际互认。
检测流程
检测项目
抑制剂结合亲和力测定:定量评估抑制剂与目标蛋白质之间的结合强度,常用KD值表示。
靶点选择性分析:在复杂蛋白质组背景下,评估抑制剂对预设靶点与非预期靶点的结合差异。
结合动力学参数检测:测定抑制剂与靶蛋白的结合速率常数(kon)与解离速率常数(koff)。
共价结合位点鉴定:对于共价抑制剂,精确鉴定其在靶蛋白上的特异性修饰位点。
竞争性结合实验:评估不同抑制剂对同一靶点的竞争能力,或抑制剂与天然底物/配体的竞争关系。
细胞热迁移分析:通过温度扰动下靶蛋白的热稳定性变化,间接检测细胞内抑制剂的结合情况。
磷酸化修饰水平变化:检测抑制剂作用后,信号通路中关键靶蛋白磷酸化状态的改变。
蛋白质降解产物监测
:针对PROTAC等降解剂,监测目标蛋白被诱导降解后的产物与效率。脱靶效应全谱扫描
:在全蛋白质组范围内系统性识别抑制剂的所有潜在相互作用蛋白。药效学生物标志物发现
:寻找并验证能够反映抑制剂靶向作用的特异性蛋白质生物标志物。检测范围
重组纯化蛋白:使用表达纯化的单一目标蛋白进行高精度、高灵敏度的体外结合分析。
细胞裂解液:在接近生理状态的细胞裂解物体系中评估抑制剂的结合特性与选择性。
完整活细胞:在活细胞原位环境下研究抑制剂的跨膜能力、细胞内靶点占据及功能性影响。
组织匀浆液:从动物或临床组织样本中提取蛋白质,用于评价抑制剂在复杂组织微环境中的靶向性。
血浆/血清样本:检测循环系统中抑制剂与可溶性靶蛋白的结合情况,或评估其蛋白结合率。
亚细胞器组分:聚焦于线粒体、细胞核、溶酶体等特定细胞器内的蛋白质组,研究其区室化靶向。
免疫沉淀复合物:对免疫共沉淀或亲和纯化后的蛋白质复合物进行检测,分析抑制剂对复合体的影响。
化学探针标记样品:利用基于抑制剂结构的活性导向探针标记的蛋白质组样品,进行选择性富集与鉴定。
疾病模型样本:涵盖癌症、神经退行性疾病等模型的组织或细胞样本,评估抑制剂在病理状态下的靶向效率。
临床前与临床样本:包括动物药代动力学/药效学样本及患者活检组织,用于转化研究与生物标志物验证。
检测方法
表面等离子共振技术:通过实时监测生物分子结合引起的折射率变化,获取动力学和亲和力数据。
等温滴定量热法:精确测量结合过程中释放或吸收的热量,直接得到热力学参数。
CETSA与TPP:基于质谱的细胞热迁移分析及热蛋白质组学分析,用于活细胞及全蛋白质组水平的靶点鉴定。
亲和选择质谱法:将抑制剂固定于固相支持物上,从复杂混合物中捕获并鉴定其结合的蛋白质。
活性导向蛋白质组学分析:使用带有报告标签的化学探针,共价标记并富集活性位点,通过质谱鉴定靶点。
限速蛋白酶解技术:利用蛋白酶解速率的变化来探测蛋白质与小分子结合引起的构象改变。
荧光偏振/各向异性检测:基于分子旋转速度变化引起的荧光偏振改变,用于快速筛选和亲和力测定。
AlphaScreen/AlphaLISA技术:一种均相、高灵敏的放大化学发光检测方法,适用于高通量相互作用研究。
蛋白质微阵列技术:将成千上万个蛋白质点印在芯片上,高通量筛选抑制剂的相互作用蛋白。
基于质谱的定量蛋白质组学:采用TMT、SILAC、DIA等技术,全局性定量分析抑制剂处理前后蛋白质组的差异。
检测仪器设备
高分辨率质谱仪:如Orbitrap系列、Q-TOF等,用于精确鉴定和定量蛋白质及修饰位点。
表面等离子共振仪:如Biacore系列,专门用于实时、无标记的生物分子相互作用分析。
等温滴定量热仪: 如MicroCal ITC,直接测量生物分子结合的热力学参数。
高通量荧光检测仪强>
: 配备偏振光模块的酶标仪,适用于荧光偏振等均相检测实验的高通量读取。<强>CETSA专用实时荧光定量PCR系统强>
: 用于传统CETSA实验中靶蛋白热稳定性变化的检测(基于抗体)。<强>高性能液相色谱系统强>
: 与质谱联用,用于复杂样品的高效分离,是LC-MS/MS的核心组成部分。<强>自动化液体处理工作站强>
: 实现样品前处理、试剂添加等步骤的自动化,提高通量和重复性。<强>毛细管电泳系统强>
: 用于基于迁移率变化的相互作用分析或高分辨分离。<强>蛋白质芯片点样与扫描系统强>
: 用于制备蛋白质微阵列并读取相互作用的信号。<强>细胞培养与处理设备强>
: 包括CO2培养箱、生物安全柜等,用于制备高质量的活细胞及组织样本。