本检测详细阐述了基于荧光定量PCR技术测定标本核酸浓度的核心流程与技术要点。本检测系统性地介绍了从检测项目定义、适用范围、具体操作方法到关键仪器设备四个主要方面,每个方面均列举了十个关键项目并加以说明,旨在为分子生物学实验室提供一份标准化的操作参考与技术解析。
核心优势
检测中心实验室配备国内外的前沿分析检测设备,检测报告获得CNAS、CMA双重认证,国际互认。
检测流程
检测项目
病原体核酸定量检测:针对特定病毒、细菌等病原体的核酸进行绝对定量,用于判断感染负荷和疗效评估。
基因表达水平分析:通过检测特定基因的mRNA转录本拷贝数,分析其在生物样本中的相对或绝对表达量。
转基因成分定量:对食品、农产品中的转基因成分进行精确定量,以满足法规与标识要求。
microRNA定量分析:对血清、血浆等样本中微量的microRNA进行高灵敏度定量,常用于疾病标志物研究。
细胞因子mRNA定量:检测免疫细胞中各类细胞因子mRNA的表达水平,以评估免疫应答状态。
病毒载量监测:连续监测患者体内(如HIV、HJianCe、HCV)的病毒核酸浓度变化,指导抗病毒治疗。
拷贝数变异分析:对基因组特定区域的拷贝数进行定量,用于遗传病、肿瘤研究等领域。
质粒DNA浓度测定:对提取的质粒DNA进行精确定量,确保下游转化、转染等实验的准确性。
残留DNA检测:在生物制品(如疫苗、重组蛋白)中定量检测宿主细胞残留DNA的含量。
标准品绝对定值:为核酸标准物质或参考品提供精确的拷贝数浓度定值,作为定量检测的基准。
检测范围
临床标本:包括血清、血浆、全血、咽拭子、肺泡灌洗液、尿液、脑脊液等各类人体样本。
培养细胞:贴壁或悬浮培养的动物、植物或微生物细胞及其裂解液。
组织样本:经石蜡包埋或新鲜冷冻的动物、植物组织切片或匀浆。
法医样本:血迹、唾液斑、毛发等微量或降解的DNA样本的定量分析。
环境样本:水体、土壤、空气滤膜中提取的微生物或环境DNA。
食品与农产品:加工或未加工的食品、饲料、种子中提取的核酸。
质粒与PCR产物:纯化后的质粒DNA、PCR扩增产物、寡核苷酸等。
病毒载体:腺病毒、慢病毒、AAV等基因治疗载体的基因组滴度测定。
细胞游离DNA:血浆、血清中循环肿瘤DNA等微量游离DNA的定量。
RNA样本:总RNA、mRNA、小RNA等,需在反转录为cDNA后进行定量。
检测方法
TaqMan探针法:使用序列特异性荧光探针,通过报告基团与淬灭基团分离产生荧光信号,特异性极高。
SYBR Green I染料法:使用能结合双链DNA的荧光染料,通过监测PCR过程中总双链DNA的荧光增量进行定量。
分子信标技术:采用茎环结构的发夹型探针,杂交时构象改变产生荧光,背景低,特异性强。
数字PCR:将样本分割成数万个微反应单元进行终点PCR,通过计数阳性单元实现绝对定量,不依赖标准曲线。
竞争性定量PCR:在样本中加入已知浓度的竞争性内标,通过内标与靶序列的扩增竞争关系进行定量。
一步法RT-qPCR:将反转录与荧光定量PCR在同一反应管中连续进行,适用于RNA病毒的快速定量。
两步法RT-qPCR:先独立完成反转录反应生成cDNA,再以cDNA为模板进行荧光定量PCR,灵活性更高。
多重荧光定量PCR:在同一反应体系中同时检测多个靶标,使用不同荧光标记的探针加以区分,提高通量。
高分辨率熔解曲线分析:在PCR后通过缓慢升温并监测荧光变化,可鉴别产物特异性及单核苷酸多态性。
标准曲线法定量:使用已知精确浓度的标准品绘制标准曲线,根据待测样本的Ct值计算其初始模板量。
检测仪器设备
实时荧光定量PCR仪:核心设备,具备热循环模块、光学检测系统和数据分析软件,用于实时监测荧光信号。
核酸提取仪:自动化完成样本的裂解、核酸结合、洗涤和洗脱步骤,保证核酸纯度和提取效率。
超微量分光光度计:用于快速测定微量核酸样本的浓度(ng/μL)和纯度(A260/A280比值)。
荧光计:使用荧光染料(如PicoGreen)专一性结合核酸,比紫外分光光度法更灵敏、特异性更强。
数字PCR系统:包含微滴生成仪、PCR扩增仪和微滴读取仪,用于实现基于泊松分布的绝对定量。
生物安全柜:提供无菌操作环境,防止样本污染并保护操作者,尤其适用于病原体核酸提取。
高速冷冻离心机:用于样本预处理、核酸沉淀、细胞收集等步骤,确保样本制备质量。
涡旋混合器:快速混匀反应液,确保反应体系各组分均匀分布,对结果重复性至关重要。
微量移液器:精确移取微升级液体,是构建高精度反应体系的基础工具,需定期校准。
超纯水系统:提供无核酸酶、无污染的超纯水,用于配制所有试剂和反应体系,避免背景干扰。
