本检测详细介绍了二维凝胶电泳分析这一核心蛋白质组学技术。文章系统阐述了该技术的检测项目、检测范围、检测方法及所需仪器设备,旨在为研究人员提供一份全面、结构化的技术指南,涵盖从样品制备到图像分析的完整流程及其在生物医学领域的广泛应用。
核心优势
检测中心实验室配备国内外的前沿分析检测设备,检测报告获得CNAS、CMA双重认证,国际互认。
检测流程
检测项目
蛋白质等电点测定:根据蛋白质在pH梯度凝胶中迁移至净电荷为零的位置,确定其等电点。
蛋白质分子量测定:通过蛋白质在SDS-PAGE凝胶中的迁移率,与标准品对比,确定其表观分子量。
蛋白质表达谱分析:比较不同样品(如疾病与正常)中蛋白质点的丰度差异,筛选差异表达蛋白。
蛋白质翻译后修饰检测:通过点的位移或特定染色,初步检测磷酸化、糖基化等修饰。
蛋白质复合物组分分离:将复杂蛋白质混合物分离成单个蛋白点,用于后续的组分鉴定。
蛋白质纯度评估:通过观察凝胶上点的数量和形态,评估蛋白质样品的纯度。
蛋白质异构体分离:分离因翻译后修饰或剪切不同而产生的、分子量相近但电荷不同的蛋白质异构体。
生物标志物筛选:通过差异分析寻找与特定生理状态或疾病相关的特征性蛋白质点。
蛋白质相互作用初筛:结合免疫共沉淀等技术,分析共沉淀蛋白在凝胶上的分布。
样品制备质量评估:观察凝胶图像的背景、条纹和点形,评估样品提取和溶解效果。
检测范围
细胞全蛋白提取物:适用于分析细菌、酵母、动植物细胞裂解后的全蛋白组分。
组织全蛋白提取物:适用于心、肝、脑、肿瘤等多种生物组织的蛋白质组分析。
血清/血浆样本:用于寻找疾病相关的血液生物标志物,但需去除高丰度蛋白。
亚细胞器蛋白:如线粒体、细胞核、微粒体等细胞器分离后的蛋白质组研究。
植物组织蛋白:特别适用于分析叶片、根、种子等植物材料的蛋白质表达。
微生物全蛋白组:广泛用于细菌、真菌等微生物在不同条件下的蛋白质表达变化研究。
重组蛋白样品:用于检查重组蛋白的表达水平、纯化效果及是否存在修饰。
蛋白质复合物样品:适用于经过免疫沉淀或亲和纯化后的简单蛋白质混合物分析。
体液样本(如尿液、脑脊液):用于无创或微创的生物标志物发现研究。
药物处理后的细胞/组织样本:用于研究药物作用机制及寻找药效相关的蛋白靶点。
检测方法
第一向等电聚焦:基于蛋白质等电点差异,在预制或自制的IPG胶条中进行分离。
IPG胶条平衡:在IEF后,用含SDS和还原剂的缓冲液处理胶条,为第二向电泳做准备。
第二向SDS-PAGE:将平衡后的IPG胶条置于SDS聚丙烯酰胺凝胶上端,根据分子量进行垂直分离。
考马斯亮蓝染色法:使用R-250或G-250染料进行通用性染色,灵敏度中等,操作简便。
银染法:通过银离子还原显色,灵敏度高,可达纳克级,但与质谱兼容性需优化。
荧光染色法:如SYPRO Ruby染料,灵敏度高,动态范围宽,与质谱兼容性好。
图像采集与分析:使用高分辨率扫描仪或成像系统获取图像,并用专业软件进行点检测、匹配和量化。
胶内酶切:从凝胶上切取目标蛋白点,用胰蛋白酶等进行胶内消化,生成肽段。
质谱样本制备:将酶切后的肽段从凝胶中萃取出来,脱盐并点靶,用于质谱鉴定。
差异凝胶电泳:在电泳前用不同荧光染料标记不同样品,在同一块胶上运行以提高比对准确性。
检测仪器设备
等电聚焦仪:提供精确的温度和电压控制,用于第一向IPG胶条的重泡胀和聚焦。
垂直电泳槽系统:用于进行第二向SDS-PAGE分离,通常为大尺寸凝胶设计。
IPG胶条与胶条槽:固定pH梯度的干胶条及放置胶条进行重泡胀和聚焦的专用槽。
精密电子天平:用于精确称量药品、试剂和样品,保证实验重复性。
pH计:用于精确配制各种缓冲液,特别是等电聚焦相关试剂。
高速离心机与超速离心机
超声细胞破碎仪:用于有效裂解细胞和组织,释放细胞内蛋白质。
凝胶成像系统:包括白光或激光扫描仪、荧光成像仪等,用于高分辨率采集凝胶图像。
图像分析软件
基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱仪
